Система КИСМ включает в себя несколько модулей, покрывающих разные аспекты функционирования СМ:
Подсистема мониторинга показателей процессов и достижения целей
Подсистема мониторинга показателей КИСМ позволяет непрерывно контролировать наиболее важные параметры процессов 
    и достижения целей предприятия/компании, оперативно принимать решения при недостижении установленных показателей.
Подсистема планирования и проведения аудитов
Подсистема планирования и проведения аудитов КИСМ автоматизирует управление внутренними и внешними аудитами:
- Создание и согласование программ, планов и графиков аудитов,
 - Планирование отдельных аудитов,
 - Проведение отдельных аудитов,
 - Формирование отчетов по результатам проведения аудитов,
 - Автоматическое и ручное создание наблюдений.
 
Подсистема планирования и проведения внутренних и внешних проверок
Подсистема планирования и проведения внутренних и внешних проверок позволяет спланировать, провести и зафиксировать результаты проверок
     
Подсистема отработки претензий потребителей
Подсистема отработки претензий потребителей автоматизирует процессы по урегулированию претензий, которые проводятся в организации, в том числе анализ полученной информации, и включает в себя:
- Обмен информацией
 - Получение претензий
 - Отслеживание претензий
 - Подтверждение претензий
 - Первоначальная оценка претензий
 - Расследование претензий
 - Реагирование на претензии
 - Сообщение решения
 
Подсистема работы с несоответствиями и наблюдениями 
Подсистема работы с несоответствиями и наблюдениями КИСМ агрегирует и систематизирует информацию обо всех наблюдениях (единичных/системных/потенциальных несоответствиях, хороших практиках, областях для улучшений, рекламациях) и записях ИСМ/СМ, возникающих в компании в ходе реализации процессов ИСМ/СМ. Подсистема предлагает несколько стандартных схем различного уровня сложности для отработки наблюдений, позволяющих всесторонне и максимально эффективно проработать выявленный факт нарушения требований или хорошую практику.
Подсистема работы с рисками и возможностями 
Подсистема управления рисками и возможностями КИСМ позволяет организовать в едином информационном пространстве компании управление рисками и возможностями, включая:
- Идентификацию рисков и возможностей,
 - Анализ рисков и возможностей,
 - Планирование, согласование и реализацию мероприятий в отношении рисков и возможностей,
 - Проведение мониторинга рисков и возможностей на периодической основе,
 - Ведение реестра критических и значимых рисков,
 - Ведение плана мероприятий по минимизации критических и значимых рисков.
 
Подсистема управления документацией
Подсистема управления документацией позволяет реализовать весь спектр задач по работе с внешними и внутренними нормативными и техническими документами предприятия и/или холдинга. Может работать как часть системы КИСМ и как самостоятельное решение (так называемой КБНТИ).
Подсистема управления проектами
Подсистема управления проектами позволяет автоматизировать процессы инициации, планирования, выполнения, контроля и закрытия проекта и включает в себя следующие возможности:
- Инициация проекта - формирование инициативы, целевых показателей, ограничений и рисков проекта, команды проекта.
 - Планирование проекта - процесс разработки, согласования и утверждения годовых планов проектов. Разработка календарного плана работ проекта.
 - Реализация и контроль выполнения проекта - отслеживание выполнения календарного плана работ проекта, контроль исполнения, индикация работ, выполняющих с задержками, а также работ, выполненных в срок.
 - Завершение и мониторинг проекта - оценка проекта в рамках завершения проекта.
 
Подсистема аналитики КИСМ позволяет получать различные срезы по хранимым в КИСМ данным - объектам (аудитам, наблюдениям, рискам, претензиям и пр.)